[Todos] se busca estudiante

Alejandro Colman-Lerner alerner2 en gmail.com
Vie Abr 15 15:38:14 ART 2011


El laboratorio de Biología de Sistemas Moleculares del IFIBYNE (FCEN-UBA)
busca un estudiante de licenciatura en biología, química o carreras afines
para realizar la tesina de licenciatura (o equivalente) durante el 2011 y
que esté en condiciones de presentarse a beca doctoral CONICET este año,
para comenzar en 2012.



El interés general del laboratorio es entender los mecanismos que llevan a
“decisiones de destino celular” (“cell fate decisions”). Si bien estudiamos
los detalles de los mecanismos moleculares, nos interesa principalmente
explicar a nivel del sistema los comportamientos que causan estas
decisiones. Estos comportamientos resultan comúnmente de la interacción de
un número relativamente grande de componentes, por lo que en general resulta
difícil comprender su funcionamiento. Por eso, en el laboratorio combinamos
experimentación cuantitativa con simulaciones matemáticas, con el objetivo
de derivar reglas generales. Esto es lo que corrientemente se conoce
como enfoque
de biología de sistemas. Mayormente utilizamos como modelo a la
levadura *Saccharomyces
cerevisiae.*



El estudiante se integrará en un proyecto enfocado en entender las bases
moleculares de un mecanismo de decisión de destino celular, la expresión
génica asimétrica dependiente del factor de transcripción Ace2 en levaduras.
Los mecanismo que resultan en expresión génica asimétrica son responsables
de gran parte de la diversidad celular presente en organismos
multicelulares, y ha sido descriptos en bacterias, levaduras, gusanos,
moscas y mamíferos. En nuestro caso particular, el mecanismo último que
causa la asimetría en la actividad de Ace2 no ha sido dilucidado aún y es en
el laboratorio el tema central de una tesis doctoral avanzada. (ver
referencias para una descripción de la biología del proceso en cuestión y
tener una idea del enfoque del laboratorio).



El estudiante investigará la dinámica de transporte nuclear de dicho factor
y un posible mecanismo nuevo de regulación de la actividad transcripcional.
Se utilizarán enfoques de microscopía cuantitativa confocal, biología
molecular y modelado matemático.



No es necesario que los postulantes tengan conocimientos previos en modelado
matemático o programación. Sí es indispensable buena disposición para los
enfoques matemáticos y computacionales, y para el trabajo experimental.



Los interesados por favor envíen un CV actualizado al Dr. Alejandro Colman
Lerner (colman-lerner at fbmc.fcen.uba.ar). En el cuerpo del mensaje por favor
incluir una breve explicación de por qué les interesaría incorporarse al
laboratorio.



Referencias:

1.    Chernomoretz, A., Bush, A., Yu, R., Gordon, A., and Colman-Lerner, A.
(2008). Using Cell-ID 1.4 with R for microscope-based cytometry. Current
protocols in molecular biology / edited by Frederick M Ausubel  et al* Chapter
14*, Unit 14 18.

2.    Colman-Lerner, A., Chin, T.E., and Brent, R. (2001). Yeast Cbk1 and
Mob2 activate daughter-specific genetic programs to induce asymmetric cell
fates. Cell* 107*, 739-750.

3.    Colman-Lerner, A., Gordon, A., Serra, E., Chin, T., Resnekov, O.,
Endy, D., Pesce, C.G., and Brent, R. (2005). Regulated cell-to-cell
variation in a cell-fate decision system. Nature* 437*, 699-706.

4.    Gordon, A., Colman-Lerner, A., Chin, T.E., Benjamin, K.R., Yu, R.C.,
and Brent, R. (2007). Single-cell quantification of molecules and rates
using open-source microscope-based cytometry. Nat Methods* 4*, 175-181.

5.    Ventura, A.C., Sepulchre, J.A., and Merajver, S.D. (2008). A hidden
feedback in signaling cascades is revealed. PLoS Comput Biol* 4*, 14.

6.    Yu, R.C., Pesce, C.G., Colman-Lerner, A., Lok, L., Pincus, D., Serra,
E., Holl, M., Benjamin, K., Gordon, A., and Brent, R. (2008). Negative
feedback that improves information transmission in yeast signalling. Nature*
 456*, 755-761.

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     Alejandro Colman-Lerner

Investigador Adjunto

IFIByNE-CONICET y

Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular

Faculad de Ciencias Exactas y Naturales

Universidad de Buenos Aires
Ciudad Universitaria - Pabellon 2 - 2º piso
(C1428EHA) Buenos Aires - Argentina
Tel: 54-11-4-576-3386 /4-576-3368, int 119
FAX: 54-11-4-576-3321










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