[Todos FBMC] taller bioinformatica estructura proteinas 21-23/11/2017

Norberto Daniel Iusem norbius en fbmc.fcen.uba.ar
Jue Nov 2 12:49:55 ART 2017


>Hola,
>les paso info sobre un interesante taller de 
>bioinformatica de estructura de proteinas 
>organizado por el Dr. Tony Gibson (EMBL 
>Heidelberg), desarrollador del software de 
>alineamiento multiple CLUSTAL_W (paper en NAR 
>con mas de 47.000 citas!) y la Dra. Lucia 
>Chemes, destacada docente de esta Facultad 
>especializada en motivos lineales de proteinas intrinsecamente desordenadas.

saludos
Norberto Iusem
Profesor Titular FCEN-UBA
Investigaor Principal IFIByNE-CONICET



>Se encuentra abierta la inscripcion al Workshop 
>"Bioinformatics tools for Protein Structure, 
>Disorder and Interaction Analysis" a realizarse 
>en el IIB-INTECH del 21 al 23 de Noviembre de 
>2017 (de 9 a 18 hs). Se adjunta Flyer del curso.
>
>El curso esta orientado a estudiantes de 
>doctorado y postdocs con formacion en biologia 
>molecular experimental. Cupo: 25 alumnos
>
>Organizadores: Toby Gibson (EMBL, Heidelberg) y Lucia Chemes (IIB-INTECH)
>
>Informacion: lchemes at iib.unsam.edu.ar <mailto:lchemes at iib.unsam.edu.ar>
>Pagina Web del curso: 
>https://sites.google.com/view/cursoproteinasunsam 
>  <https://sites.google.com/view/cursoproteinasunsam>
>
>
>Descripcion del curso: La transmisión de 
>señales celulares es llevada a cabo por 
>complejos macromoleculares dinámicos que pueden 
>unirse, disociarse, relocalizarse y cambiar sus 
>componentes. El estado de estos complejos es 
>modulado mediante modificaciones 
>post-traduccionales, y una vez que los mismos 
>han transmitido la señal, pueden ser 
>desmantelados y degradados. A pesar de su gran 
>importancia, estos complejos regulatorios aún 
>están poco descriptos. La estructura de 
>dominios de las proteínas que forman parte de 
>estos complejos determina el tipo de 
>interacciones establecidas. Muchas de estas 
>interacciones están mediadas por regiones 
>flexibles o “intrínsecamente desordenadas” 
>que codifican importantes funciones 
>(interacción, fosforilación, ubiquitinación) 
>a través de elementos funcionales denominados 
>“motivos lineales”. Este Workshop 
>presentará un conjunto de herramientas 
>bioinformáticas que permiten explorar la 
>estructura, regiones funcionales e interacciones 
>de proteínas que participan en las redes de señalización eucariotas.
>
>
>
>Toby Gibson, PhD: El Dr. Toby Gibson es Team 
>Leader de la Unidad de Biología Computacional y 
>Estructural de EMBL, Heidelberg. Obtuvo su 
>doctorado de Cambridge University (1984) y 
>realizó estudios postdoctorales bajo la 
>dirección de S. Brenner. El Dr. Gibson se 
>especializó en el análisis de módulos 
>funcionales en proteínas mediante alineamientos 
>múltiples de secuencias. Es co-autor del 
>algoritmo de alineamiento Clustal. La 
>repercusión de este desarrollo se refleja en 
>dos trabajos seminales que figuran entre los 10 
>papers más citados de la historia (ver*, más 
>de 70.000 citas entre ambos). Posteriormente, 
>fue pionero en el campo del estudio de motivos 
>lineales en proteínas, creando la base de datos 
>ELM (Eukaryotic Linear Motif Database, 
>http://elm.eu.org <http://elm.eu.org/>), que 
>constituye la base de datos de referencia en 
>motivos lineales eucariotas. Sus trabajos han 
>sido altamente citados (índice h = 58).
>
>
>
>* Thompson, J. D., Higgins, D. G. and Gibson, T. 
>J. (1994). Clustal-W: Improving The Sensitivity 
>Of Progressive Multiple Sequence Alignment 
>Through Sequence Weighting, Position-Specific 
>Gap Penalties And Weight Matrix Choice. NAR, 22: 4673. 47.232 citas
>
>* Thompson, J. D. et al. (1997) The CLUSTAL_X 
>windows interface: flexible strategies for 
>multiple sequence alignment aided by quality 
>analysis tools. NAR, 25, 4876. 30.263 citas
>
>  * Puntervoll et al. (2003) ELM server: A new 
> resource for investigating short functional 
> sites in modular proteins. NAR, 31, 3625. 449 citas
>
>
>
>Fecha: 21 al 23 de Noviembre de 201Lugar: IIB-INTECH
>
>Av. 25 de Mayo y Francia
>
>Campus Miguelete, UNSAM
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