[Todos FBMC] Seminario de Toby Gibson (autor del supercitado algoritmo de alineamiento CLUSTAL)

Norberto Daniel Iusem norbius en fbmc.fcen.uba.ar
Jue Nov 16 12:47:08 ART 2017


>Estimados colegas,
>
>Este viernes 17 de Noviembre a las 13-14 horas, tendremos un seminario
>extraordinario a cargo del Dr Toby Gibson, PhD (EMBL, Heidelberg) quien se
>encuentra visitando nuestro pais en estos dias.
>El seminario sera en el Aula Cardini, 4to Piso. Departamento de
>Quimica Biologica, FCEN, UBA. Pabellon 2.
>
>Titulo: "Complexity of cell regulation and perturbation of short linear
>motifs in disease"
>
>Abstract: Organisms have to respond to many challenges and insults during
>their lifetimes. As a result, they have developed very complex cell
>regulatory systems. At the core are regulatory protein which make massive
>numbers of interactions. This is achieved through the use of short linear
>motifs, since folded protein domains cannot provide sufficient surfaces of
>interaction. Yet these systems can themselves be subverted during disease.
>In the talk, I will review what we understand about cell regulatory
>systems and discuss examples of SLiM abuse in cancer and when hijacked by
>pathogens.
>
>El Dr. Toby  Gibson es Team Leader de la Unidad 
>de Biologia Computacional y Estructural de EMBL, 
>Heidelberg. Especialista en el analisis de modulos
>funcionales en proteinas mediante alineamientos multiples de secuencias.
>Es co-autor del algoritmo de alineamiento Clustal, que figura entre los 10
>papers mas citados de la historia [1, 2] con mas de 70.000 citas. Es
>pionero en el campo del estudio de motivos lineales en proteinas y creador
>de la base de datos ELM (Eukaryotic Linear Motif Database,
>http://elm.eu.org)[3]. Actualmente, continua trabajando en el campo de
>regulacion de la senializacion intracelular por motivos lineales [4], y su
>desregulacion en enfermedades infecciosas y cancer [5, 6].
>
>REFERENCIAS:
>[1] Thompson, J. D., Higgins, D. G. and Gibson, T. J. (1994). Clustal-W:
>Improving The Sensitivity Of Progressive Multiple Sequence Alignment
>Through Sequence Weighting, Position-Specific Gap Penalties And Weight
>Matrix Choice. NAR, 22: 4673. 43.234 citas
>[2] Thompson, J. D. et al. (1997) The CLUSTAL_X windows interface:
>flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality
>analysis tools. NAR, 25, 4876. 27.121 citas
>[3] Puntervoll et al. (2003) ELM server: A new resource for investigating
>short functional sites in modular proteins. NAR, 31, 3625. 439 citas
>[4] Tompa P, Davey NE, Gibson TJ, Babu MM. A million peptide motifs for
>the molecular biologist. Mol Cell. 2014 Jul 17;55(2):161-9
>[5] Davey NE, Travé G, Gibson TJ. How viruses hijack cell regulation.
>Trends Biochem Sci. 2011 Mar;36(3):159-69
>[6] Mészáros B, Kumar M, Gibson TJ, Uyar B, Dosztányi Z. Degrons in
>cancer. Science Signaling 10(470). doi: 10.1126/scisignal.aak9982
>
>
>Seminarios libres y sin inscripción previa
>Los esperamos,
>
>________________________________________________
>
>Sub-Comisión Organizadora de Seminarios:
>Dra.Alaimo, Dr.Bueno, Dr. Craig, Dra.Erlejman Dra.Kristoff
>
><http://www.qb.fcen.uba.ar/>www.qb.fcen.uba.ar
>Departamento de Química Biológica
>Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
>Universidad de Buenos Aires.
>
>4to Piso - Aula Cardini
>Intendente Güiraldes 2160 - Pabellon II
>Ciudad Universitaria
>Buenos Aires - Argentina
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